DNTT

DNTT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2COE, 4I27, 1KEJ, 1JMS
Ідентифікатори
Символи	DNTT, TDT, DNA nucleotidylexotransferase, Terminal deoxynucleotidyl transferase
Зовнішні ІД	OMIM: 187410 MGI: 98659 HomoloGene: 3014 GeneCards: DNTT
шифр КФ	2.7.7.31
Онтологія гена Молекулярна функція • трансферазна активність • зв'язування з ДНК • DNA-directed DNA polymerase activity • nucleotidyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • зв’язування з іоном металу • DNA nucleotidylexotransferase activity • ДНК-полімераза • DNA polymerase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0035327 Еухроматин • ядерний матрикс • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • DNA metabolic process • DNA biosynthetic process • DNA modification • response to ATP • double-strand break repair via nonhomologous end joining Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1791	21673
Ensembl	ENSG00000107447	ENSMUSG00000025014
UniProt	P04053	P09838
RefSeq (мРНК)	NM_001017520 NM_004088	NM_001043228 NM_009345
RefSeq (білок)	NP_001017520 NP_004079	NP_001036693 NP_033371
Локус (UCSC)	Хр. 10: 96.3 – 96.34 Mb	Хр. 19: 41.02 – 41.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNTT (англ. DNA nucleotidylexotransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 536.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPPRASHLS		PRKKRPRQTG		ALMASSPQDI		KFQDLVVFIL		EKKMGTTRRA
FLMELARRKG		FRVENELSDS		VTHIVAENNS		GSDVLEWLQA		QKVQVSSQPE
LLDVSWLIEC		IRAGKPVEMT		GKHQLVVRRD		YSDSTNPGPP		KTPPIAVQKI
SQYACQRRTT		LNNCNQIFTD		AFDILAENCE		FRENEDSCVT		FMRAASVLKS
LPFTIISMKD		TEGIPCLGSK		VKGIIEEIIE		DGESSEVKAV		LNDERYQSFK
LFTSVFGVGL		KTSEKWFRMG		FRTLSKVRSD		KSLKFTRMQK		AGFLYYEDLV
SCVTRAEAEA		VSVLVKEAVW		AFLPDAFVTM		TGGFRRGKKM		GHDVDFLITS
PGSTEDEEQL		LQKVMNLWEK		KGLLLYYDLV		ESTFEKLRLP		SRKVDALDHF
QKCFLIFKLP		RQRVDSDQSS		WQEGKTWKAI		RVDLVLCPYE		RRAFALLGWT
GSRQFERDLR		RYATHERKMI		LDNHALYDKT		KRIFLKAESE		EEIFAHLGLD
YIEPWERNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Riley L.K., Morrow J.K., Danton M.J., Coleman M.S. (1988). Human terminal deoxyribonucleotidyltransferase: molecular cloning and structural analysis of the gene and 5' flanking region. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 2489—2493. PMID 2833741 doi:10.1073/pnas.85.8.2489
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Koiwai O., Morita A. (1988). Isolation of putative promoter region for human terminal deoxynucleotidyltransferase gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 154: 91—100. PMID 3395350 doi:10.1016/0006-291X(88)90654-7
• Peterson R.C., Cheung L.C., Mattaliano R.J., Chang L.M.S., Bollum F.J. (1984). Molecular cloning of human terminal deoxynucleotidyltransferase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81: 4363—4367. PMID 6087320 doi:10.1073/pnas.81.14.4363
• Mahajan K.N., Mitchell B.S. (2003). Role of human Pso4 in mammalian DNA repair and association with terminal deoxynucleotidyl transferase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 10746—10751. PMID 12960389 doi:10.1073/pnas.1631060100
• Yang B., Gathy K.N., Coleman M.S. (1994). Mutational analysis of residues in the nucleotide binding domain of human terminal deoxynucleotidyl transferase. J. Biol. Chem. 269: 11859—11868. PMID 8163485

Див. також

• Хромосома 10