DSC1

DSC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IRY
Ідентифікатори
Символи	DSC1, CDHF1, DG2/DG3, desmocollin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 125643 MGI: 109173 HomoloGene: 22761 GeneCards: DSC1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном кальцію • зв’язування з іоном металу Клітинна компонента • інтегральний компонент мембрани • щілинні контакти • міжклітинні контакти • Десмосома • екзосома • мембрана • зроговіла оболонка • клітинна мембрана • ficolin-1-rich granule membrane • cell-cell junction Біологічний процес • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • keratinization • дегрануляція нейтрофілів • cornification • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1823	13505
Ensembl	ENSG00000134765	ENSMUSG00000044322
UniProt	Q08554	P55849
RefSeq (мРНК)	NM_024421 NM_004948	NM_001291804 NM_013504
RefSeq (білок)	NP_004939 NP_077739	NP_001278733 NP_038532
Локус (UCSC)	Хр. 18: 31.13 – 31.16 Mb	Хр. 18: 20.22 – 20.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DSC1 (англ. Desmocollin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 99 987.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALASAAPGS		IFCKQLLFSL		LVLTLLCDAC		QKVYLRVPSH		LQAETLVGKV
NLEECLKSAS		LIRSSDPAFR		ILEDGSIYTT		HDLILSSERK		SFSIFLSDGQ
RREQQEIKVV		LSARENKSPK		KRHTKDTALK		RSKRRWAPIP		ASLMENSLGP
FPQHVQQIQS		DAAQNYTIFY		SISGPGVDKE		PFNLFYIEKD		TGDIFCTRSI
DREKYEQFAL		YGYATTADGY		APEYPLPLII		KIEDDNDNAP		YFEHRVTIFT
VPENCRSGTS		VGKVTATDLD		EPDTLHTRLK		YKILQQIPDH		PKHFSIHPDT
GVITTTTPFL		DREKCDTYQL		IMEVRDMGGQ		PFGLFNTGTI		TISLEDENDN
PPSFTETSYV		TEVEENRIDV		EILRMKVQDQ		DLPNTPHSKA		VYKILQGNEN
GNFIISTDPN		TNEGVLCVVK		PLNYEVNRQV		ILQVGVINEA		QFSKAASSQT
PTMCTTTVTV		KIIDSDEGPE		CHPPVKVIQS		QDGFPAGQEL		LGYKALDPEI
SSGEGLRYQK		LGDEDNWFEI		NQHTGDLRTL		KVLDRESKFV		KNNQYNISVV
AVDAVGRSCT		GTLVVHLDDY		NDHAPQIDKE		VTICQNNEDF		AVLKPVDPDG
PENGPPFQFF		LDNSASKNWN		IEEKDGKTAI		LRQRQNLDYN		YYSVPIQIKD
RHGLVATHML		TVRVCDCSTP		SECRMKDKST		RDVRPNVILG		RWAILAMVLG
SVLLLCILFT		CFCVTAKRTV		KKCFPEDIAQ		QNLIVSNTEG		PGEEVTEANI
RLPMQTSNIC		DTSMSVGTVG		GQGIKTQQSF		EMVKGGYTLD		SNKGGGHQTL
ESVKGVGQGD		TGRYAYTDWQ		SFTQPRLGEK		VYLCGQDEEH		KHCEDYVCSY
NYEGKGSLAG		SVGCCSDRQE		EEGLEFLDHL		EPKFRTLAKT		CIKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• King I.A., Arnemann J., Spurr N.K., Buxton R.S. (1993). Cloning of the cDNA (DSC1) coding for human type 1 desmocollin and its assignment to chromosome 18. Genomics. 18: 185—194. PMID 8288219 doi:10.1006/geno.1993.1453
• King I.A., Magee A.I., Rees D.A., Buxton R.S. (1991). Keratinization is associated with the expression of a new protein related to the desmosomal cadherins DGII/III. FEBS Lett. 286: 9—12. PMID 1713860 doi:10.1016/0014-5793(91)80929-W
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 doi:10.1002/elps.200600782
• Choi H.J., Gross J.C., Pokutta S., Weis W.I. (2009). Interactions of plakoglobin and beta-catenin with desmosomal cadherins: basis of selective exclusion of alpha- and beta-catenin from desmosomes. J. Biol. Chem. 284: 31776—31788. PMID 19759396 doi:10.1074/jbc.M109.047928
• Theis D.G., Koch P.J., Franke W.W. (1993). Differential synthesis of type 1 and type 2 desmocollin mRNAs in human stratified epithelia. Int. J. Dev. Biol. 37: 101—110. PMID 8507556

Див. також

• Хромосома 18